微生物在成长繁衍过程中，还能按捺多种土传病害的发作和开展，对根结线虫病也具有很强的按捺效果，微生物菌肥是一种无毒、经济、环保的新式肥料，值得在出产中加以推广应用。
在合理施用微生物菌肥时应留意以下几点：
1.挑选证件齐全含菌量高的产品。
2.微生物菌肥自身营养含量低，必须与其他肥料调配施用。在施用微生物菌肥时，由于微生物菌肥中的微生物具有固氮、解磷、解钾、抑菌、活化土壤、进步营养利用率的效果，因而施用这类肥料后，能够恰当削减化肥的施用量。
3.微生物菌肥中的微生物需要在含水适合的土壤中才能成长和繁衍，因而土壤湿度不能过干过湿。
4.微生物菌肥不能和杀菌剂一起运用。
5.微生物菌肥不论是做基肥，还是追肥，都不能暴露在土壤外表。由于阳光照耀，使微生物的活性下降
通过施微生物菌肥，削减化肥的施用量，能够明显地起到改进土壤，下降出产成本，进步蔬菜质量的效果。这是由于微生物菌肥在施用过程中，能够起到活化土壤，分化被土壤固定的营养，然后进步肥料的吸收利用率，一起微生物菌肥中的微生物，在成长和繁衍过程中，能够发生植物成长素，影响作物成长，然后改进蔬菜的质量。
用生物技术出产出来的微生物菌肥料, 不只能为作物供给很多的有用营养, 并且能分化土壤中长期施用化肥、农药的残留, 溶解污水灌溉后的重金属残毒, 净化环境。微生物的活动又能改进土壤的理化性状, 进步土壤有机质含量, 一起微生物菌肥多以优质草炭为载体, 其中草炭中含很多的植物必需的微量元素。这种功用其它化学肥料不具备。微生物菌肥不污染环境这一主要特点, 更是其它化学肥料无法比拟的。